skip to main content
Ngôn ngữ:
Giới hạn tìm kiếm: Giới hạn tìm kiếm: Dạng tài nguyên Hiển thị kết quả với: Hiển thị kết quả với: Chỉ mục

Sequanix: a dynamic graphical interface for Snakemake workflows

Desvillechabrol, Dimitri ; Legendre, Rachel ; Rioualen, Claire ; Bouchier, Christiane ; Van Helden, Jacques ; Kennedy, Sean ; Cokelaer, Thomas

Bioinformatics, 2018, Vol. 34(11), pp.1934-1936 [Tạp chí có phản biện]

ISSN: 1367-4803 ; E-ISSN: 1460-2059 ; DOI: 10.1093/bioinformatics/bty034

Toàn văn sẵn có

Trích dẫn Trích dẫn bởi
  • Nhan đề:
    Sequanix: a dynamic graphical interface for Snakemake workflows
  • Tác giả: Desvillechabrol, Dimitri ; Legendre, Rachel ; Rioualen, Claire ; Bouchier, Christiane ; Van Helden, Jacques ; Kennedy, Sean ; Cokelaer, Thomas
  • Chủ đề: Biology
  • Là 1 phần của: Bioinformatics, 2018, Vol. 34(11), pp.1934-1936
  • Mô tả: We designed a PyQt graphical user interface-Sequanix-aimed at democratizing the use of Snakemake pipelines in the NGS space and beyond. By default, Sequanix includes Sequana NGS pipelines (Snakemake format) (http://sequana.readthedocs.io), and is also capable of loading any external Snakemake pipeline. New users can easily, visually, edit configuration files of expert-validated pipelines and can interactively execute these production-ready workflows. Sequanix will be useful to both Snakemake developers in exposing their pipelines and to a wide audience of users.Availability and implementation: Source on http://github.com/sequana/sequana, bio-containers on http://bioconda.github.io and Singularity hub (http://singularity-hub.org).Contact: dimitri.desvillechabrol@pasteur.fr or thomas.cokelaer@pasteur.fr.Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
  • Số nhận dạng: ISSN: 1367-4803 ; E-ISSN: 1460-2059 ; DOI: 10.1093/bioinformatics/bty034

Đang tìm Cơ sở dữ liệu bên ngoài...